有特別強在哪嗎?

這... 怎麼說 ... 以後 Eclipse sync 時完全對錯就讓 winmerge 比看看就知道啦

是因為Format錯才使得Eclipse弄錯嗎?\

不一定是 format 錯。有時候真的改了。Eclipse 比較常把相同行視做不同行。

是不是換plugin就可以解決?

應該是吧